云南黄连是滇西北高黎贡山地区最负盛名的药用植物之-，始载于明朝兰茂的《滇南本草》，多为野生，质量好，但商品量也小，《清宫医案》将云连列为极品，提倡使用本种。在印度和孟加拉国，民间将其具有苦味的根茎作为药物广泛使用也有相当悠久的历史。由于长期过度采挖和生境不断遭到破坏，本种的野生居群已处于灭绝的边缘，在中国被列为二级濒危保护植物，渐危种。按世界自然保护联盟濒危物种红色名录的濒危等级和标准，应将本种列为濒危（EN）-级，理由是观察、估计或推测种群在过去的10年或3个世代内，致危因素没有停止，至少减少50%，虽未达到极危，但在可预见的不久将来，其野生状态下灭绝的机率极大
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